Pokémon: Mewtwo Returns (2001)

Der Anführer von Team Rocket, Giovanni, hat Mewtu in einer abgelegenen Gegend der Johto-Region gefunden. Während Giovanni versucht, Mewtu zurückzuerobern, werden Ash und seine Freunde von Domino, einem neuen Team Rocket-Mitglied, entführt, während sie versuchen, Pikachu vor Jessie und James zu retten. Die Klon-Pokémon werden ebenfalls gefangen genommen und dann als Köder für Mewtu verwendet. Die Situation wird dann zu einem Kampf zwischen den Willen von Mewtwo und Giovanni; und Mewtu versucht auch herauszufinden, ob es und die Klone einen Sinn im Leben haben, obwohl sie Produkte der Wissenschaft sind.